A expansão das novas tecnologias e ferramentas de sequenciamento permitiram um avanço na descoberta funcional de numerosos ecossistemas microbianos.
As técnicas moleculares, baseadas em técnicas de DNA avançaram muito nos últimos 40 anos e são de grande importância na segurança dos alimentos, tendo sido incorporada nos sistemas de vigilância para monitoramento bacteriano na produção de alimentos no mundo todo (OYARZABAL; KATHARIOU, 2014).
Esse destaque também se dá pela aplicação do sequenciamento de próxima geração, já que a relação de alto rendimento e baixo custo permite obter informações mais completas e profundas, atraindo cada vez mais os olhares da indústria e ampliando o campo de aplicação (DEVASIA et al., 2019).
Quais as aplicações do sequenciamento DNA dentro da indústria?
O uso do sequenciamento de DNA pela indústria é possível e tem aumentado a procura, já que este é um método preciso e eficaz para ter conhecimento sobre o microbioma dos alimentos. São inúmeras aplicações, veja algumas:
- Estudos epidemiológicos – É uma ferramenta indispensável em estudos epidemiológicos, permitindo associar os produtos alimentares aos patógenos transmitidos por alimentos, auxilia na compreensão da distribuição e aparecimento de doenças e surtos (OYARZABAL; KATHARIOU, 2014).
- Principais patógenos de origem alimentar – É possível identificar de forma rápida os principais patógenos bem como muitas das toxinas produzidas por bactérias de origem alimentar, incluindo: Bacillus, Campylobacter Jejuni, Cronobacter, Clostridium, Escherichia Coli, Listeria Monocytogenes, Salmonela, Staphylococcus aures, Vibrio Cholerae (OYARZABAL; KATHARIOU, 2014).
- Fraudes em alimentos – A autenticidade dos alimentos é importante tanto para as agências reguladora, produtores, processadores e consumidores. O sequenciamento de próxima geração pode ser aplicado para evitar que práticas fraudulentas afetem negativamente a indústria (HAYNES et al., 2019). Um exemplo é o uso dessa tecnologia para evitar fraudes no tipo de carnes, evitando rotulagem indevida em carne processada e produtos avícolas (XING et al., 2019).
- Identificação de biofilmes – Com a tecnologia de sequenciamento de última geração é possível realizar estudos comparativos de metagenômica, fornecendo dados funcionais, comparações taxonômicas e perfil de comunidade (biofilmes). Um exemplo disso é o uso da análise comparativa metagenômica de tubos de concretos corroídos, que revelou populações bacterianas associadas a ciclo de enxofre e nitrogênio (GOMEZ-ALVAREZ, 2014).
- Descobertas de enzimas de importância industrial – Integração das técnicas de genômica, transcriptômica, proteômica e metagenômica podem fornecer meios eficazes para minerar e descobrir inovações na biodiversidade, acelerando a descoberta de enzimas industrialmente importante (DEVASIA et al., 2019).
Referências
DEVASIA, V. L. A. et al. Technological advancements in industrial enzyme research. Advances in Biological Science Research, [s. l.], p. 85–102, 2019. Disponível em: <https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/B9780128174975000069>.
GOMEZ-ALVAREZ, V. Biofilm-Growing Bacteria Involved in the Corrosion of Concrete Wastewater Pipes: Protocols for Comparative Metagenomic Analyses. In: DONELLI, G. (Ed.). Microbial Biofilms – Methods and Protocols. 1. ed. Rome, Italy: Springer, 2014. p. 323–340.
HAYNES, E. et al. The future of NGS (Next Generation Sequencing) analysis in testing food authenticity. Food Control, [s. l.], v. 101, p. 134–143, 2019. Disponível em: <https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0956713519300581>.
OYARZABAL, O. A.; KATHARIOU, S. DNA Methods in Food Safety – Molecular Typing of Foodborne and Waterborne Bacterial Pathogens. 1. ed. Chichester, UK: John Wiley & Sons, Ltd, 2014. Disponível em: <http://doi.wiley.com/10.1002/9781118278666>.
XING, R.-R. et al. Application of next generation sequencing for species identification in meat and poultry products: A DNA metabarcoding approach. Food Control, [s. l.], v. 101, p. 173–179, 2019. Disponível em: <https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0956713519300829>.